En las finales del Torneo Apertura 2006 de Segunda División Profesional, Pachuca Juniors desplegó un fútbol ofensivo para superar de manera contundente en el partido de vuelta a los rojinegros del Atlas 3-0 en el estadio Hidalgo y se proclamó campeón del grupo de equipos de ascenso, en tanto que Chivas San Rafael se coronó en el grupo de filiales al supera por global de 6-1 a Toluca.
Por el equipo campeón estuvieron Humberto Hernández, Gilberto Martínez, Iván Pérez, Luis Montes, José Francisco Torres, Willie Guerrero, Edwin Hernández, Edy Brambila, Hernán Fernández, Rodolfo Fajardo, Héctor Hernández, dirigidos por Rubén Ayala.